RS Islam Yarsi Pontianak memiliki Visi yaitu Terwujudnya Rumah Sakit yang Islami, Berkualitas dan Mandiri. Dengan Misi Mewujudkan RS yang Islami dengan Pelayanan Prima, Bekerja secara Profesional dan bermoral, Mandiri dengan SDM yang berkualitas, dan Turut serta membantu Pemerintah meningkatkan derajat kesehatan bangsa.