Rumah Sakit PKU Muhammadiyah Yogyakarta semula Klinik berdiri pada tanggal 15 Februari 1923, dibawah naungan PKU Muhammadiyah. RS PKU Muhammadiyah memiliki Visi mewujudkan Rumah Sakit Pendidikan dengan keunggulan layanan kesehatan, pendidikan dan riset serta kemitraan yang kuat tahun 2018. Dengan Misi pelayanan publik, pendidikan, penelitian, pengembangan dan dakwah.